Suite à son installation à Henri Moissan en juillet 2022, la plateforme de cytométrie en flux PLAIMMO de l'Unité Mixte de Service "Ingénierie et Plateformes au Service de l'Innovation Thérapeutique"(UMS-IPSIT) est devenue CYM (Cytométrie Henri Moissan). Le personnel de la plateforme, accompagné par sa référente scientifique, le Pr Géraldine Schlecht, a relancé ses activités pour vous accompagner dans la réalisation de projets de recherche fondamentale ou préclinique, ainsi que dans la mise en place de protocoles de recherche clinique nécessitant l'utilisation d'un cytomètre. Après l’installation des laboratoires, l’objectif premier a été de dynamiser et faire découvrir les possibilités de la cytométrie au sein de l’Université Paris-Saclay. Marie-Laure Aknin, responsable de la plateforme CYM, a sollicité l’ensemble des plateformes de l’écosystème de l’Université Paris-Saclay dans l’objectif de créer un réseau de cytométrie de proximité. La dynamique très positive, apparue dès les premières réunions, a permis de choisir collégialement le nom de ce réseau d’experts, baptisé CyPSay (Cytométrie Paris-Saclay).
Ce réseau, créé tout début 2023, regroupe à ce jour 8 plateformes : CYM (ex PLAIMMO, IPSIT / Plateforme de Cytométrie H. Moissan), SpICy (ICP / SpectroImageries et Cytométrie), FlowCyTech (IDMIT, Institut JACOB) et I2BC / Plateforme de cytométrie (IMAGERIE-GIF) d’une part, ensemble qui vient compléter le réseau des plateformes présent sur le biocluster GENOPOLE nommé OCCIGEN. Ce réseau génopolitain regroupe les équipements complémentaires présents sur ImCy (Imagerie-Cytométrie, GENETHON), sur la plateforme de bioproduction (cellulaire, automatisée) de l’I-Stem, au LGRK (Laboratoire de Génomique et Radiobiologie de la Kératinopoïèse, Institut JACOB) et sur la plateforme de tri et clonage de levures opérée par Hybrigenics Services. Le réseau recense aujourd’hui une vingtaine d’équipements dont une quinzaine d’analyseurs : Fortessa (BD Biosciences) ; cytoFLEX S et cytoFLEX LX (Beckman Coulter) ; Partec (Sysmex) ; NovoCyte 3000 (Agilent), MACS Quant 10 et MACS Quant X (Miltenyi) ; SP6800 (Sony), très souvent situés à proximité de trieurs : SH800 (Sony) ; ARIA IIu et ARIA Fusion (BD Biosciences) ; MoFlo AstriosEQ et cytoFLEX SRT (Beckman Coulter).
L’objectif du réseau est de partager les expertises respectives des partenaires à travers des réunions régulières, de discuter des évolutions des technologies pour acquérir et analyser des données de cytométrie, d’identifier les besoins en investissements et de se fédérer pour des demandes de financement d’instruments et/ou de logiciels spécifiques. A travers ce Focus Plateforme, nous souhaitons rendre encore plus visible ce réseau proposant un accompagnement optimal de tous vos projets en cytométrie et promouvoir la découverte de cette technologie à travers différentes journées de formation ou séminaires ouvertes à tous.
Le réseau a organisé une première journée de formation de cytométrie en flux le 26 octobre dernier à Henri Moissan. Cette journée a été l’occasion de présenter les différentes plateformes du réseau puis de proposer une formation théorique sur les bases de la cytométrie, réalisée par Mr Jean-Baptiste Guillerme de la société Biolegend. Cette journée fut une belle réussite avec environ 40 participants. L’enquête de satisfaction a démontré un bon niveau de satisfaction. Le réseau CyPSay travaille déjà à l’organisation d’une deuxième journée, à laquelle vous serez prochainement invités. Nous espérons vous y retrouver très nombreux !
Pour tout renseignement complémentaire, n'hésitez pas à contacter la plateforme du réseau CyPSay la plus proche.
IPSIT / Plateforme de Cytométrie H.Moissan (CYM). La plateforme de cytométrie en flux (CYM) de l'Unité Mixte de Service, Ingénierie et Plateformes au Service de l'Innovation Thérapeutique (UMS-IPSIT), située au rez-de-chaussée du bâtiment Recherche Henri Moissan (HM1) offre régulièrement ses services aux équipes de recherche académiques du territoire Paris-Saclay ainsi qu'aux industriels. Le personnel de la plateforme est à votre disposition pour vous aider à la réalisation de projets de recherche fondamentale, préclinique sur des modèles expérimentaux ainsi que pour des protocoles de recherche clinique. Son personnel est aussi à votre service pour la mise au point de nouvelles techniques utilisant la cytométrie en flux. Les équipements de cytométrie en flux de la plateforme permettent le phénotypage des cellules par la détection de molécules membranaires et intracellulaires (biomarqueurs) mais aussi des études fonctionnelles telles que la détection de phosphorylation des protéines, la prolifération cellulaire, la quantification de cytokines ou chimiokines excrétées ou la détection d'ARN. Enfin, des tris cellulaires à haut débit sont aussi proposés par la plateforme. Nos activités qui peuvent être en relations avec celle d'autre plateforme, permettent l'identification de nouveaux biomarqueurs pouvant être des cibles thérapeutiques.
A propos d’IPSIT. IPSIT (Ingénierie et Plateformes au Service de l’Innovation Thérapeutique) est une Unité Mixte de Service placée sous les tutelles conjointes de l’UPSaclay (UMS-IPSIT), l’Inserm (US31) et le CNRS (UAR3679). L’IPSIT regroupe 11 plateformes techniques, organisées en trois pôles technologiques (IMCELLF, OMICS et INTERACTIONS) et trois plateformes transverses. L’IPSIT se veut résolument à l’interface de la chimie, de la biologie et de la clinique en établissant le lien entre la cible pathologique et le médicament. L’IPSIT est adossée à une Structure Fédérative de Recherche (SFR) qui rassemble l’UMS-et 25 équipes de recherche. Enfin, IPSIT participe à l’animation scientifique et à la formation des étudiants et des personnels tout en contribuant au rapprochement d’équipes d’horizons différents et à la transdisciplinarité des collaborations. Voir aussi leur FOCUS PLATEFORME décrivant toutes leurs expertises !
Les bactériophages sont des virus qui infectent les bactéries et sont considérés comme les entités vivantes les plus abondantes sur la Terre. Plusieurs enseignants-chercheurs appartenant à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule - I2BC (CNRS/CEA/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) se sont associés afin de découvrir de nouveaux phages infectant la bactérie Corynebacteriumglutamicum, organisme essentiel pour la production mondiale de glutamate. Seuls six phages de C. glutamicum ont été caractérisés jusqu’à présent.
Dans le cadre des enseignements de licence de biologie à l’université Paris-Saclay, des prélèvements de sols et d’eau ont été réalisés par douze étudiants de 2ème année. Le phage PSonyx, capable d’infecter C. glutamicum, a ainsi été purifié à partir du bassin de la Tuilerie à Massy. A l’aide du microscope électronique de l’I2BC, les étudiants ont observé que la particule virale était un phage caudé avec une queue flexible. Le matériel génétique qu’ils ont purifié a été séquencé grâce au programme de coopération universitaire international SEA-PHAGES (Science Education Alliance- Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science). Ensuite, 21 étudiants de 3ème année ont pris le relais pour analyser le génome de 80 kb. Les deux tiers des 141 gènes échappent à toute prédiction fonctionnelle et représentent un réservoir de fonctions antibactériennes à haut potentiel en biotechnologies.
Les résultats de ces enseignements innovants ont été publiés dans Microbiology Resource Announcements. Les 33 étudiants impliqués dans le projet font partie des auteurs de l’article : un tremplin important pour ces étudiants de licence vers la recherche !
Les acides aminés lévogyres (L-) sont majoritairement retrouvés dans les tissus animaux. Malgré la faible prévalence des acides aminés dextrogyres (D-), ils peuvent être retrouvés naturellement sous forme libre ou intégrés dans des protéines et peptides. Une altération de la régulation de production de ces acides aminés peut avoir des effets importants sur l’organisme, notamment dans le cas de pathologies liées à l’âge comme Alzheimer, où la production de ces acides aminés D- est exacerbée. Ces énantiomères sont considérés comme biomarqueurs potentiels et aucune technique n’est encore capable de les détecter et quantifier à faible concentration en raison de leurs masses et charges nettes identiques. Le développement d’une nouvelle méthode de détection de ces énantiomères représenterait donc un avancement majeur dans le domaine du diagnostic.
Le LAMBE (Laboratoire Analyse, Modélisation, Matériaux pour la Biologie et l'Environnement, UEVE/UPSaclay/CNRS/Cergy Paris Université, Evry‑Courcouronnes) a démontré, grâce à une technique de détection électrique par nanopore, l’identification et la discrimination de deux peptides biomarqueurs différents d’un seul acide aminé énantiomère : la L-Arginine et D-Arginine Vasopressine. Ces travaux ont été publiés dans ACS Central Science. Ces deux peptides ont été discriminés grâce à leurs conformations spécifiques en conditions natives ou réductrices. Afin d’identifier spécifiquement les signaux électriques attribués à chaque énantiomère, une analyse en composante principale puis une approche de Monte Carlo ont été utilisées.
Les principes actifs d’origine naturelle ont joué un rôle fondamental dans l’évolution de la pharmacie, contribuant à des avancées significatives en matière d’espérance de vie grâce à des traitements tels que les antibiotiques, les antiparasitaires et les anticancéreux. À l’ère des révolutions technologiques, notamment les sciences « omiques » et les sciences des données, ainsi que de l’émergence de nouvelles approches holistiques de la science, la biodiversité continue plus que jamais de fournir aux scientifiques des molécules biologiquement actives.
Mehdi Beniddir et Erwan Poupon, membres de l’équipe « Chimie des Substances Naturelles » de BioCIS – Biomolécules : Conception, Isolement, Synthèse (UMR 8076 CNRS/UPSaclay, Orsay), présentent dans un article prospectif publié dans les Comptes Rendus de l’Académie des Sciences, leur analyse de la situation et des défis en 2024 concernant les médicaments « issus de la nature ». Ils dressent également un panorama des différentes initiatives qui visent à fédérer le domaine de la chimie des substances naturelles notamment dans le cadre de l’université Paris-Saclay.
Certaines drogues et certains médicaments peuvent provoquer une hypertension artérielle pulmonaire (HTAP). La liste de ces médicaments est fréquemment mise à jour et ils sont classés entre « possiblement » et « définitivement » associés à l’HTAP. Le Bortezomib et le Carfilzomib sont des inhibiteurs du protéasome (IP), qui ont récemment été classés comme possiblement associés à l’HTAP dans les dernières recommandations.
Une étude dirigée par le Pr David Montani, de l’UMR-S 999 « Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique » (INSERM/UPSaclay, Le Plessis-Robinson et Le Kremlin-Bicêtre) et du Service de Pneumologie, Centre de Référence de l’Hypertension Pulmonaire (AP-HP, Hôpital Bicêtre), s’est penchée sur les caractéristiques des patients du registre Français développant une HTAP après exposition aux IP, concomitamment à une méta-analyse et une étude de disproportionnalité portant sur la base de données de l’OMS : Vigibase®. Publiée dans le European Respiratory Journal, l’étude a identifiée 11 patients ayant développé une HTAP après exposition aux IP dans le registre Français de l’HTAP : 6 après exposition au Carfilzomib, 5 après exposition au Bortezomib. L’étude de disproportionnalité a identifiée 166 cas d’HTAP après exposition aux IP depuis 2013, et l’étude de disproportionnalité a mis en évidence un signal statistiquement significatif pour le carfilzomib quelle que soit la définition, et le signal était inconstant pour le Bortezomib. La méta-analyse a identifié 17 essais cliniques et le Carfilzomib était associé de manière significative a un plus haut risque de dyspnée, dyspnée sévère et d’HTAP en comparaison au Bortezomib.
L’étude conclut que les IP peuvent induire une HTAP et que le Carfilzomib est associé à un signal plus fort que le Bortezomib, et ces patients doivent être surveillés régulièrement.
Légende Figure : 3 méthodes complémentaires utilisées pour l’analyse des cas d’HTAP associés aux inhibiteurs du protéasome. Le Carfilzomib émet un signal plus fort que le Bortezomib.
S'ils paraissent souvent réfléchis et éclairés, nos choix résultent toujours, en fait, d'un complexe engrenage cérébral gouverné par notre inconscient.
Qu’ils soient anodins ou déterminants pour notre futur, tous nos choix résultent d’une opération cérébrale. Les psychologues suspectaient donc l’existence, dans le cerveau, d’un mécanisme évaluant les différentes options et orientant le choix vers celle qui avait notre préférence… Or, ces dernières années, les neuroscientifiques ont prouvé que c’était bien le cas. Mieux : plusieurs des structures cérébrales impliquées dans le processus de décision ont été identifiées (voir infographie). Et contrairement à ce que l’on pourrait croire, certaines d’entre elles prennent racine très profondément dans le cerveau, là où même la lumière de la conscience ne pénètre pas. Nos choix s’appuient donc sur une large part d’inconscient.
Dans le cortex orbito-frontal
Toutefois, avant de s’aventurer dans les tréfonds de notre encéphale, encore faut-il définir ce qu’est la conscience. Si plusieurs théories s’affrontent à son sujet, toutes la définissent comme la capacité à nous rapporter nos propres états et ressentis mentaux. Et toutes la voient émerger dans le cortex cérébral, c’est-à-dire la couche supérieure des hémisphères cérébraux. Particulièrement développée chez les humains, cette région est désignée comme le siège des “fonctions supérieures”, c’est-à-dire du raisonnement, du langage, de la mémoire, de la commande des mouvements volontaires, etc.
Forcément, c’est d’abord là que les neuroscientifiques ont traqué les neurones spécialisés dans la prise de décision. Et qu’ils les ont trouvés ! « Dès qu’il y a un choix à faire, que ce soit chez l’homme ou l’animal, nous voyons que le cortex orbito-frontal s’active », témoigne Sylvie Granon, de l’université Paris-Saclay (Institut des Neurosciences Paris-Saclay - NeuroPSI, UMR 9197, CNRS/UPSaclay). « Cette région semble chargée, entre autres, de représenter la valeur des différentes options. »
Dans une étude publiée dans Food Research International, les scientifiques de l’UMR SayFood (Paris-Saclay Food and Bioproduct Engineering, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau) ont étudié les mécanismes de stabilisation d’émulsions à base d’un co-produit végétal non fractionné. Le marc de pomme est un co-produit du pressage des jus dont la production mondiale est estimée à 4 millions de tonnes métriques par an. Sa revalorisation en alimentation humaine présenterait de nombreux avantages allant de la récupération de biomolécules d’intérêt à la limitation des pertes alimentaires et à la pollution organique des sols (substrat entre très riche en eau, sucres et acides organiques). Cependant sa composition complexe et hétérogène reste un challenge. Cette étude a donc proposé d’utiliser un plan d’expériences multicritère et multicontrainte afin d’identifier et hiérarchiser les facteurs impactant la structuration et stabilisation d’émulsions par une poudre de marc de pomme ni fractionnée, ni purifiée, ni chimiquement modifiée.
31 émulsions ont été formulées pour générer une grande diversité de propriétés fonctionnelles (texture, microstructure, couleur, stabilité…). Au sein de cet espace produit, l’approche statistique a permis de prendre en compte les interactions entre les 3 facteurs testés (teneur en huile, teneur en marc de pomme et vitesse de mélange), évitant l’approche essai-erreur. La part soluble du marc de pomme et la taille des particules solides pilotent la taille des gouttes d’huile. La vitesse de mélange est responsable du taux d’adsorption des particules à l’interface huile-eau. Ainsi, la modélisation prédictive a permis l’évaluation des relations structure-fonction au sein d’un système dispersé uniquement stabilisé par un ingrédient non fractionné.
Ce travail a été mené dans le cadre de la thèse de Charlotte Hollestelle.
L’évaluation in vitro et in vivo des micelles perfluorées a permis de mettre en évidence des avantages clés de la plateforme nanométrique en tant qu'outil théranostique : (i) une petite taille, permettant une pénétration profonde dans les tissus ; (ii) le transport d'oxygène vers les tissus hypoxiques ; (iii) une toxicité négligeable en l'absence de radiations ionisantes ; (iv) une internalisation dans les cellules cancéreuses ; (v) un puissant effet radiosensibilisant ; et (vi) d’excellentes propriétés de ciblage des tumeurs, démontrée grâce à la l’imagerie par tomographie par émission de positons (TEP).
Ces plateformes micellaires sont modulables « à façon » et permettent un suivi par imagerie en temps réel de leur accumulation tumorale associée à un effet radiosensibilisant, pour une approche théranostique du cancer.
Dans une étude parue dans Blood, des scientifiques de l’unité Hémostase Inflammation Thrombose (UMR-S 1176 INSERM/UPSaclay, Le Kremlin-Bicêtre) ont examiné l'effet du fitusiran (un siRNA qui réduit l'expression de l'antithrombine) sur la production de thrombine et le potentiel hémostatique in vivo en cas de déficience en FX. Alors que l'hémophilie A et B a vu des progrès avec des thérapies non factorielles comme l'emicizumab et le fitusiran, le déficit en FX reste sans solution. Le fitusiran semble prometteur pour les patients avec un faible taux de FX. Dans l'hémophilie A et B, il vise à réduire les taux d'antithrombine à 15-35% de la normale, ce qui normalise la génération de thrombine et diminue les saignements.
Les chercheurs ont créé un modèle de souris exprimant une activité et un antigène FX <1% (souris f10low). Les souris f10low présentent une formation quasi-absente de thrombus dans un modèle de lésion vasculaire et saignent davantage dans 2 modèles de saignements. Le fitusiran réduit l'activité antithrombine à 17±6%, augmente la production de thrombine de 4 fois, et dans différents modèles de saignements améliore significativement le phénotype hémorragique des souris f10low démontrant que le fitusiran a le potentiel d’améliorer l’hémostase en cas de déficit en FX.
Dans une revue publiée dans Annals of Intensive Care, les chercheurs de l’unité de soins intensifs de l’hôpital Ambroise Paré (AP-HP/UVSQ, Boulogne Billancourt) et du Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations – CESP (UMR-S 1018 Inserm/UPSaclay) rapportent les structures et les process impliqués, depuis le préhospitalier jusqu'à la réadaptation finale, dans la prise en charge de patients souffrant de sepsis dans une optique de réduction de la morbidité et la mortalité associées au sepsis.
Les chances de survie sont maximisées lorsque les étapes suivantes s’enchainent et sont optimisées : reconnaissance précoce, évaluation de la gravité, activation du système de secours d'urgence préhospitalières (si disponible), insaturation précoce des traitements (antibiothérapie et optimisation hémodynamique), orientation vers une structure de soins adéquate, réanimation des défaillances d'organes, contrôle de la source infectieuse et enfin intégration dans un programme de réhabilitation réadaptation.
La coordination de cet ensemble de soins dédiés au sepsis correspond à la chaîne de survie du sepsis nécessitant l’interconnexion parfaite de chaque maillon.
Le développement et l'optimisation de la chaine de survie devraient permettre de réduire considérablement la mortalité et la morbidité liées au sepsis alors qu’à ce jour, malgré les recommandations internationales, l’adhésion à ces dernières demeure faible.
L’édition des ARN est un phénomène de maturation qui modifie la séquence des transcrits par rapport à la séquence génomique. Dans les chloroplastes et mitochondries des plantes terrestres (embryophytes), des centaines de cytosines sont ainsi spécifiquement désaminées en uracile. La spécificité de reconnaissance de ces cytosines est assurée par les protéines PPR (pentatricopeptide repeat) qui constituent le cœur du complexe d’édition, l’éditosome. Elles se composent d’un domaine PPR capable de lier des séquences spécifiques d’ARN et d’un domaine catalytique en C-terminal qui réalise la réaction d’édition. Il existe cependant de nombreuses protéines PPR impliquées dans l’édition qui sont dépourvues de ce domaine catalytique (sous-familles E2 et E+) et qui théoriquement ne devraient pas être capables d’éditer les cytosines.
Dans une étude publiée dans Plant Science, l’équipe Organellar Gene Expression de l’Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay – IPS2 (CNRS/INRAE/UEVE/UPCité/UPSaclay, Gif-sur-Yvette) montre que ces protéines PPR tronquées sont complémentées fonctionnellement par une sous-famille atypique de protéines PPR qui ont un très court domaine PPR (voir aucun !) mais un domaine catalytique fonctionnel. La création et l’expression d’une PPR d’édition classique tronquée dans son domaine catalytique afin de mimer des membres de ces sous-familles E2 et E+ (qui n’ont pas le domaine catalytique), montre que ces protéines peuvent toujours éditer leurs transcrits cibles. Le croisement de ces lignées avec des mutants de PPR atypiques (qui n’ont que le domaine catalytique) montre que ces dernières complémentent spécifiquement certaines sous-familles en apportant leurs domaines catalytiques et cette complémentation peut être stabilisée par la présence d’une troisième PPR. L’association de ces protéines permet alors de reconstituer un facteur d’édition complet et le cœur de l’éditosome.
Julien Pothlichet a récemment obtenu la Chaire Inserm sur le projet intitulé “Immunosurveillance & Skin Virome: relationship and role in inflammatory conditions”. Il a ainsi rejoint le 1er Février 2024 l’UMR-S 996 « Inflammation, Microbiome et Immunosurveillance » (INSERM/UPSaclay) dirigée par Françoise Bachelerie au sein de la Faculté de Pharmacie UPSaclay à Orsay.
Passionné par les interactions virus/hôtes, Julien Pothlichet les étudie depuis plus de 22 ans dans différents postes académiques et industriels. Lors de sa thèse d’Immunologie (Institut Gustave Roussy) il a fait la preuve de concept (POC) que les rétrovirus endogènes exprimés par les tumeurs peuvent inhiber la réponse immune antitumorale in vivo. Il a ensuite identifié les mécanismes d’action (MOA) de récepteurs qui détectent l’infection par le virus de la grippe A (IAV) et induisent la réponse innée des cellules épithéliales pulmonaires (ex vivo et in vivo modèle murin) (3 postdocs, Institut Pasteur - 5 ans, Université McGill - 3 ans). Il a également apporté la POC du contrôle génétique de la réponse immunitaire à l’infection par IAV dans un modèle murin (Université McGill) et de la réponse immunitaire innée aux virus et bactéries chez l’homme (Institut Pasteur).
Chef de programme dans une start-up (Diaccurate, spin-off de l’Institut Pasteur - 8,5 ans), l’équipe qu’il dirigeait a identifié un nouveau MOA inhibiteur de la fonction T CD4 chez les patients HIV dont elle a démontré le potentiel comme cible thérapeutique pour les patients HIV mais aussi ceux atteints d’un cancer du pancréas. Il a déposé 6 brevets et développé des anticorps inhibiteurs à potentiel thérapeutique contre cette cible.
Aujourd’hui il s’intéresse aux interactions entre les papillomavirus (HPV) et leurs hôtes humains. Les HPV sont des virus commensaux qui infectent sélectivement les kératinocytes humains des épithéliums stratifiés de la peau et des muqueuses où ils résident la plupart du temps de manière asymptomatique chez les individus sains. Parmi les 440 types HPV identifiés, certains sont à potentiel oncogènes et responsables de 5% des cancers oropharyngés et ano-génitaux humains, sans traitement spécifique à ce jour. Le potentiel pathogène des HPV cutanés peut se manifester par des verrues et est suspecté jouer un rôle important comme cofacteur de l’irradiation UV dans le développement de cancer de la peau non mélanome. Afin d’améliorer notre compréhension des interactions HPV/hôte et d’identifier les facteurs viraux et cellulaires impliqués dans la transition de ces commensaux vers des pathobiontes, son projet se focalise sur la réponse innée des kératinocytes contre les HPV et l’impact des immunosuppresseurs sur la nature du virome HPV cutané. Les résultats attendus devraient permettre d’identifier de nouvelles cibles thérapeutiques, et des biomarqueurs de la dysbiose cutanée à fort potentiel pour la prévention et le traitement des cancers induits par le HPV.
Il prépare une école d’été sur les interactions Microbiote/hôte en relation avec la Graduate School Health & Drug Sciences.
« La seule source de connaissance est l’expérience. » - Albert Einstein
Najet Yagoubi, Professeur de Chimie Physique et Responsable du Master Professionnel parcours : Dispositifs Médicaux à l’université Paris-Saclay (Faculté de Pharmacie, Orsay), est intervenue à la 5ème édition du programme éducatif Vital Care sur le thème "Le marquage CE des dispositifs médicaux", en collaboration avec GMED.
En France, l’élevage de truite arc-en-ciel se fait majoritairement dans des systèmes conventionnels où l’eau est dérivée d’une rivière pour ensuite circuler à travers les bassins d’élevage avant de retourner à son cours naturel. Le manque d'espace, la disponibilité limitée en eau douce et les préoccupations environnementales notamment concernant la durabilité des aliments aquacoles sont autant d’obstacles à l’expansion de la production conventionnelle de truite. Dans ce contexte, l’aquaculture biologique suscite un intérêt croissant car potentiellement moins impactante pour l’environnement. Toutefois, les évaluations objectives comparant les impacts environnementaux de systèmes piscicoles biologiques et conventionnels sont rares, et n’existent pas pour la trutticulture.
Dans une étude publiée dans Journal of Cleaner Production, les chercheurs de l’unité de Génétique Animale et Biologie Intégrative – GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec des collègues rennais, ont utilisé l’Analyse du Cycle de Vie (ACV), approche holistique d’évaluation des impacts environnementaux, pour comparer le bilan environnemental d’une production de truites basée sur des pratiques d’élevage conventionnelles ou biologiques. Pour cela, ils ont développé un modèle réaliste de ferme piscicole, basé sur des données recueillies auprès de fermes aquacoles bretonnes en intégrant les contraintes associées à une production conventionnelle versus celles du cahier des charges de la pisciculture biologique.
Ainsi, les chercheurs ont pu montrer que la production de truite biologique réduit considérablement les impacts environnementaux par tonne de truite produite pour la plupart des catégories d'impact étudiées, avec notamment une réduction de 11% pour les émissions de gaz à effet de serre ou encore 35% de l’écotoxicité de l’eau douce. Les seules exceptions sont l’eutrophisation des eaux douces et la dépendance à l’eau, où la production biologique entraîne des impacts plus élevés par tonne de truite. Les bénéfices environnementaux de la production biologique s’avèrent plus importants quand les impacts sont exprimés par unité de surface de production plutôt que par quantité de truite produite.
En conclusion, cette étude démontre clairement les avantages environnementaux de la production de truite biologique par des approches de modélisation. Cependant, les chercheurs soulignent la nécessité d'une interprétation prudente des comparaisons d'ACV, pouvant être influencées par les choix méthodologiques d'analyse. Les généticiens travaillent maintenant à l’utilisation des ACV pour la revisite des objectifs de sélection truiticole qui prennent en compte les impacts environnementaux de cette production.
Les globules rouges du sang des mammifères contiennent, en grande quantité, une molécule appelée hème (qui donne sa couleur rouge au sang). Cette molécule qui permet notamment la fixation de l’oxygène est aussi très réactive et très toxique. Lors de l’infection, des bactéries pathogènes, comme le staphylocoque doré, envahissent le sang et provoquent une hémolyse des globules rouges. L’hème toxique libéré peut alors rentrer en contact avec le pathogène.
Le staphylocoque est capable de détecter l’hème grâce à un senseur d’un système à deux composants spécifique baptisé HssS présent sur sa membrane. La détection de l’hème par ce capteur déclenche un mécanisme de défense aboutissant à la synthèse d’une pompe d’efflux de l’hème, lui permettant de survivre dans le sang et de progresser dans l’infection.
Dans une étude publiée dans mBio, des scientifiques de de l'Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec l’unité BIAM (Université Aix Marseille/CEA/CNRS, Cadarache) ont découvert par quel mécanisme le staphylocoque doré détecte l’hème. La modélisation structurale de HssS et de son interaction avec l’hème a permis de proposer un site de fixation unique pour ce type de senseur à l’interface de la membrane et de la partie extracellulaire du capteur. Une mutagenèse de HssS associée à une étude de sa fonction et de sa capacité à lier l’hème ont permis de vérifier ce modèle.
Ce système de défense du staphylocoque lui est indispensable pour survivre dans le sang. Face aux enjeux de l’antibiorésistance, ces résultats ouvrent de nouvelles pistes de stratégies antibiotiques par la recherche d'inhibiteurs de ce biosenseur.
Ce produit peut analyser les ondes delta du cerveau et créer une piste sonore améliorant la qualité du sommeil. Il est issu des travaux effectués à l’Institut des neurosciences Paris-Saclay.
Une véritable clinique du sommeil à la maison. Voilà comment on pourrait résumer le fonctionnement de l’appareil développé par myWaves. « Il s’agit d’un patch muni d’un système enregistrant un électroencéphalogramme que l’on colle sur son front pour une nuit », détaille Jean-François Destexhe, cofondateur et CEO de la société. Une fois l’analyse effectuée, il suffit de transférer les données vers son ordinateur pour que le logiciel crée un fichier audio spécifique. « Il est proposé en trois versions (basses, aigus, mixtes) pour correspondre au goût de l’utilisateur. Celui-ci peut alors l’écouter 30 minutes au moment de s’endormir pour améliorer significativement son sommeil. »
Derrière ce remède miracle, se cachent les recherches d’Alain Destexhe, directeur de recherche CNRS à l’Institut des neurosciences Paris-Saclay (NeuroPSI, CNRS/Université Paris-Saclay). « Je travaille dans le secteur du bien-être depuis longtemps. Il se trouve que nous sommes cousins et qu’un jour au détour d’une conversation, je lui demande s’il ne travaillait pas sur une technologie liée au sommeil, se souvient le dirigeant. Il disposait justement d’une preuve de concept qu’il avait testée sur une trentaine de personnes. »
« Mais cela n’était pas suffisant à mes yeux, j’ai alors décidé d’investir dans une vraie étude clinique qui a été réalisée par le professeur Damien Léger au Centre du sommeil et de la vigilance de l’Hôtel-Dieu à Paris. » explique Jean-François Destexhe.Sur la quinzaine de patients étudiés, le résultat a été significatif pour le spécialiste, validant ainsi les travaux d’Alain Destexhe et le fonctionnement du système, dont le matériel et les algorithmes étaient déjà en cours de développement.
« Il s’agit d’un patch muni d’un système enregistrant un électroencéphalogramme que l’on colle sur son front pour une nuit. Il est proposé en trois versions (basses, aigus, mixtes) pour correspondre au goût de l’utilisateur. Celui-ci peut alors l’écouter 30 minutes au moment de s’endormir pour améliorer significativement son sommeil. »
Les solutions de biocontrôle (macroorganismes, microorganismes, substances naturelles, médiateurs chimiques) sont présentées comme des alternatives aux pesticides conventionnels car elles sont supposées avoir des impacts moindres sur la santé des écosystèmes et de l’Homme. Cependant, pour assurer la durabilité des solutions de biocontrôle, les conséquences de leur utilisation et les enjeux liés à la préservation de l’environnement doivent être documentés.
Dans une synthèse bibliographique publiée dans Environmental Science and Pollution Research, des chercheurs INRAE des UMR ECOSYS (Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau), ISA (Sophia Antipolis), Agroécologie (Dijon) et SAVE (Villenave d’Ornon), et de l’Université de Perpignan, font le point sur (1) les solutions de biocontrôle existantes, (2) la contamination de l’environnement par ces solutions, (3) leur devenir dans l’environnement, (4) leurs effets écotoxicologiques sur la biodiversité, et (5) leurs effets par rapport à ceux des pesticides conventionnels.
Si de nombreuses solutions insecticides et fongicides de biocontrôle sont disponibles, il ne se dégage pas actuellement de solutions herbicides qui puissent être considérées comme fiables et efficaces malgré l’importance des besoins.
Très peu d’études ont été publiées sur la contamination du milieu par les solutions de biocontrôle, leur devenir dans l’environnement et leurs effets. Le nombre de résultats le plus important concerne les organismes utilisés depuis plus de vingt ans (coccinelle Harmonia axyridis, bactérie Bacillus thuringiensis), et le plus souvent sous l’angle de leurs interactions avec d’autres organismes de biocontrôle. En effet, l’utilisation d’organismes vivants (micro et macroorganismes) en biocontrôle apporte une dimension spécifique par rapport aux pesticides conventionnels car ils peuvent s’implanter, se multiplier, se déplacer et coloniser d’autres milieux. Concernant les substances naturelles, les quelques résultats existants indiquent que, si la plupart d’entre elles ont une faible écotoxicité, d’autres (abamectine, phosphonates, spinosad) ont une toxicité équivalente voire supérieure à celle des pesticides conventionnels. Enfin, il n’y a presque aucun résultat concernant les médiateurs chimiques.
La connaissance des effets non intentionnels des solutions de biocontrôle s’est avérée très incomplète. Les recherches sur la contamination du milieu par ces solutions et leur écotoxicité doivent être amplifiées pour assurer la durabilité de leur utilisation.
Clémentine Chirol est chargée de recherche à l’INRAE au sein de l’UMR ECOSYS (Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes, INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau) depuis janvier 2023. L’équipe s’intéresse au fonctionnement des systèmes agricoles face aux changements globaux et explore le levier de l’agroécologie pour l’atténuation et l’adaptation au changement climatique.
Clémentine est passée par plusieurs méandres avant de s’intéresser aux sols des systèmes agricoles. Elle a suivi une formation en Géosciences à l’université Pierre et Marie Curie. Des stages Erasmus à l’université de Southampton en Angleterre lui ont apporté une spécialisation en sédimentologie et géomorphologie du littoral. Ses premières recherches se sont centrées sur le fonctionnement et la restauration d’habitats littoraux. Son doctorat suivait l’évolution de marais littoraux restaurés en Angleterre en comparant, par télédétection, la morphologie des systèmes de chenaux irrigant ces systèmes avec ceux présents dans les marais littoraux naturels non perturbés.
Au cours de deux projets postdoctoraux en Angleterre (Queen Mary University, Londres) et en France (Laboratoire Sols et Environnement, Nancy), elle s’est ouverte à de nouvelles méthodes et thématiques, en particulier l’utilisation de la tomographie à rayons X pour visualiser et caractériser l’organisation spatiale 3D des sols. Cela l’a conduite à explorer les nombreux liens entre structure et fonctionnalités des sols, telles que leur stabilité, leur capacité de rétention en eau ou leur capacité à stocker du carbone. Elle a effectué des simulations de dynamique du carbone et produit des cartographies de services écosystémiques à l’échelle d’une région aux sols contrastés comprenant forêts, prairies et cultures.
Son poste de chargée de recherche à ECOSYS lui offre l’opportunité de considérer le sol comme théâtre d’activité des microorganismes. De même qu’une forêt comporte de nombreuses niches écologiques, le sol peut être considéré comme une mosaïque dynamique de microhabitats dans lesquels les microorganismes vivent et interagissent. L’exploration de ces micro-paysages nécessite de combiner plusieurs techniques d’imagerie (tomographie à rayons X, microscopie optique, microscopie électronique…) pour caractériser leur diversité physico-chimique et structurale. Comprendre les microhabitats du sol permettrait alors de mieux appréhender la fonctionnalité des agroécosystèmes soumis aux changements globaux.
“All you have is what you are, and what you give.” - Ursula K. Leguin, The Dispossessed
Le prototype ThomX, installé à l’université Paris-Saclay, est une source de rayons X de petite taille unique au monde. Cette machine pourrait équiper des hôpitaux pour traiter le cancer ou des laboratoires de musées pour étudier leurs pièces.
Accélérateur d’électrons de l’installation ThomX au laboratoire IJCLab de l’université Paris-Saclay. Cette machine prototype fait interagir un faisceau d’électrons avec un faisceau laser pour produire des rayons X.
A quelques pas des bords de l’Yvette, sur le campus d’Orsay (Essonne) de l’université Paris-Saclay, un bâtiment cylindrique coiffé d’un épais dôme de béton dépasse les laboratoires voisins du haut de ses 22 mètres. A l’intérieur de l’« Igloo », comme il est surnommé, une machine unique est en rodage. ThomX est la source de rayons X la plus brillante et la plus compacte au monde, occupant plus de 100 mètres carrés, soit environ un quart de l’Igloo.
L’instrument a de faux airs de modèle réduit de train électrique, avec sa forme circulaire et ses « rails » disposés à 1 mètre au-dessus du sol. Les « wagons » sont des électrons circulant dans des tubes, effectuant un tour du circuit de 18 mètres en 60 nanosecondes, à la vitesse de la lumière. La « gare » est une cavité faite de miroirs dans laquelle la lumière infrarouge d’un laser est amplifiée par des rebonds successifs afin de « percuter » les électrons à chacun de leur tour.
Malgré les divers traitements thérapeutiques disponibles, tels que la chirurgie, la chimiothérapie, la radiothérapie et l'immunothérapie, le taux de mortalité associé au cancer du poumon reste élevé. Pour améliorer l'efficacité des traitements, il est crucial de cibler les modifications épigénétiques qui altèrent le cycle cellulaire, l'angiogenèse et la mort cellulaire programmée, en les combinant avec l'immunothérapie. Une étude récente (Hauguel et al., 2022) a révélé que la molécule QAPHA ((E)-3-(5-((2-cyanoquinolin-4-yl)(méthyl)amino)-2-méthoxyphényl)-N-hydroxyacrylamide) possède une double fonction en tant qu'inhibiteur de la polymérisation de la tubuline et des histones deacétylases (HDACs).
Dans une nouvelle étude parue dans Journal for ImmunoTherapy of Cancer, les scientifiques de l’UMR-S 1015 Immunologie des tumeurs et immunothérapie (INSERM/UPSaclay/Gustave Roussy, Villejuif), en collaboration avec les chercheurs de l'unité Biomolécules : conception, isolement, synthèse – BioCIS (CNRS/UPSaclay, Orsay) se sont concentrés sur l'impact de QAPHA sur la réponse immunitaire contre le cancer du poumon. Ils ont observé que QAPHA inhibe efficacement HDAC6, entraînant une augmentation de protéines telles que HSP90, le cytochrome C et les caspases, comme confirmé par une analyse protéomique. De plus, ils ont constaté que QAPHA induit la mort cellulaire immunogène (ICD) en augmentant HMGB1 in vitro, démontrant son efficacité en tant que vaccin in vivo.
De manière remarquable, même à des concentrations faibles, QAPHA a entraîné une régression tumorale complète chez environ 60% des souris traitées intratumoralement, établissant ainsi une réponse immunitaire anticancéreuse durable. De plus, le traitement par QAPHA a favorisé l'infiltration de neutrophiles, reflétant la promotion de la mort cellulaire inflammatoire. Leurs résultats ont également révélé que QAPHA augmentait l'expression de MHC-II sur les cellules tumorales, favorisant ainsi le recrutement de lymphocytes T cytotoxiques CD4+ dans l'infiltrat tumoral. Ils ont également constaté une corrélation significative entre la régression tumorale, le niveau d'expression de MHC-II et l'infiltrat de lymphocytes T CD4+ cytotoxiques.
En conclusion, QAPHA représente un nouvel inhibiteur multi-cibles prometteur capable d'induire à la fois l'ICD et la régulation à la hausse de MHC-II dans les cellules tumorales. Ces mécanismes contribuent à renforcer la réponse antitumorale spécifique des lymphocytes T cytotoxiques CD4+ in vivo dans ce modèle de cancer du poumon. Cette découverte ouvre la voie à de nouvelles pistes thérapeutiques dans le traitement du cancer.
Dans un article publié dans Nature Communications, des chercheurs de l'équipe Mutagenesis in Single Cells and Evolution - Muse;) de l'Institut Micalis (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), ont développé une méthode innovante sur cellule unique pour étudier, chez Escherichia coli, l'efficacité de la réparation des erreurs de réplication, une source majeure de mutations spontanées. Cette approche combine la microfluidique, la vidéomicroscopie et une fusion fluorescente du système MMR (Mismatch Repair), un mécanisme de réparation de l'ADN très conservé dans le monde du vivant. Elle permet de détecter et suivre en temps réel les erreurs de réplication et de distinguer celles qui sont efficacement réparées de celles qui ne le sont pas et donnent lieu à des mutations lors du cycle suivant de réplication de l'ADN.
Les résultats de l'étude révèlent qu'un grand nombre de mutations spontanées chez E. coli se produisent en raison d'une fenêtre temporelle limitée pour l'action du MMR. Comme cette contrainte affecte également les systèmes MMR des cellules eucaryotes et perturbe leur efficacité, elle pourrait expliquer l'origine des mutations spontanées de manière universelle. De plus, l'étude a révélé une variabilité de l'efficacité de réparation au sein d'une population isogénique, conduisant à des taux hétérogènes de mutations spontanées. Cette diversité pourrait avoir des conséquences évolutives importantes sur le fitness global de la population, notamment en accélérant l'émergence de la résistance aux antibiotiques.
Les cellules pigmentaires rétiniennes forment un épithélium au contact des photorécepteurs, assurant à ces derniers une homéostasie nécessaire à leur survie. Les dysfonctions ou la mort des cellules de cet épithélium entrainent la dégénérescence de la rétine et se retrouvent ainsi à l’origine de la dégénérescence maculaire liée à l’âge ou de certaines formes de rétinites pigmentaires.
La médecine régénérative est une des pistes de traitements envisagées pour remplacer cet épithélium. Dans cette optique, Le laboratoire I-Stem (UMR-S 861 Inserm/UEVE/UPSaclay, AFM-Téléthon, Corbeil‑Essonnes) développe une thérapie tissulaire basée sur des cellules rétiniennes dérivées de cellules souches pluripotentes humaines. Cependant, malgré un intérêt croissant pour ces cellules dans une perspective de thérapie cellulaire, leurs propriétés biomécaniques ont été peu étudiées.
Dans une étude publiée dans Stem Cell Reviews and Reports, les scientifiques d’I-Stem ont collaboré avec le laboratoire LAMBE (Laboratoire Analyse, Modélisation, Matériaux pour la Biologie et l'Environnement, UEVE/UPSaclay/CNRS/Cergy Paris Université, Evry‑Courcouronnes) pour étudier ces propriétés biomécaniques des épithéliums pigmentaires rétiniens dérivés de cellules souches pluripotentes humaines afin de mieux caractériser la reconstruction épithéliale in vitro.
L’utilisation d’un microscope à force atomique a ainsi permis d’étudier la structure et la biomécanique des cellules de l’épithélium pigmentaire rétinien issues de la différenciation de cellules pluripotentes humaines et au cours de la reformation épithéliale in vitro. Ces propriétés biomécaniques évoluent au cours de la formation de l’épithélium et pourraient servir de base pour définir des contrôles-qualité de produits de thérapies cellulaires destinés à être greffés.
Le dilemme du microscopiste est qu’il aimerait tout avoir, c’est à dire observer de grands volumes, à haute résolution spatiale, temporelle et en restant au plus près de l’état natif de la structure ! Afin de répondre à ces volontés, il est nécessaire de considérer les questions les plus importantes auxquelles le microscopiste veut répondre pour une expérimentation donnée telle que « j’ai besoin d’un grand volume ou de haute résolution ? j’ai besoin d’informations temporelles ou structurales ? » La microscopie corrélative (CLEM : Correlative Light and Electron Microscopy) combine les atouts de la microscopie optique et de la microscopie électronique, pour localiser et visualiser des cellules ou des structures macromoléculaires.
Pour comprendre les mécanismes biologiques de protéines impliquées dans l’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) le pôle Ultrastructure Cellulaire (plateforme MIMA2) de l’unité de Génétique Animale et Biologie Intégrative – GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec les unités UMR-S 999 « Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique » (Hôpital M Lannelongue, Le Plessis-Robinson) et le Laboratoire CarMeN (INSERM S1060 Université C Bernard – Bron) ont développé une méthode de CLEM adaptée aux grands échantillons.
Cette méthode permet la préservation du tissu pulmonaire, la reconnaissance des petites artères pulmonaires impliquées dans l’HTAP ainsi que la morphologie des cellules constitutives.
La phospho-vimentine, une des protéines d’intérêt, a été ainsi localisée au niveau des cellules endothéliales et sous endothéliales pulmonaires des petites artères ; les images obtenues en microscopie à fluorescence et en MET sont ensuite corrélées localisant finement les protéines d’intérêt.
Les patients atteints de drépanocytose peuvent développer une dysfonction cardiaque chronique dont les mécanismes physiopathologiques sont encore mal connus. Un des mécanismes évoqués est la répétition d’obstructions aiguës au niveau microcirculatoire cardiaque en lien avec la polymérisation de l’hémoglobine S lors des crises vaso-occlusives.
Les équipes des services de médecine intensive – réanimation, de médecine interne et immunologie et de cardiologie de l’hôpital Bicêtre ont publié dans le British Journal of Haematology une étude portant sur la prévalence des lésions myocardiques aiguës chez les patients drépanocytaires hospitalisés en soins intensifs pour crise vaso-occlusive. Dans cette étude portant sur 55 patients, la prévalence d’élévation de la troponine T, un marqueur particulièrement sensible de lésion myocardique aiguë, était très faible, survenant chez 5% des patients. Les auteurs n’ont par ailleurs pas mis en évidence de lien entre l’élévation de troponine T et l’existence d’une dysfonction cardiaque via des mesures échographiques de la fonction ventriculaire gauche (fraction d’éjection, strain global longitudinal).
Cette étude observationnelle indique donc que les lésions myocardiques aiguës sont rares lors des crises vaso-occlusives, et permet de progresser dans la compréhension des mécanismes à l’origine de la cardiopathie drépanocytaire.
Depuis un siècle, les travaux de recherche en biologie du sport ont permis de battre de nombreux records. Comment optimiser l’entraînement des athlètes à la recherche de performances toujours meilleures ?
Colonel Alexandra, Médecin du service santé des armées, chercheur à l’Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA)
À l’occasion des Jeux Olympiques et Paralympiques de Paris 2024, le Collège de France, en partenariat avec France Culture, organise un cycle de tables rondes : comment la physiologie est-elle mise au service des athlètes ?
Depuis un siècle, les découvertes en biologie du sport ont permis de battre de nombreux records. Les JO de Mexico en 1968 ont doppé la recherche dans le domaine et marqué l’essor de la préparation scientifique de l’entraînement. Pour améliorer les performances des sportifs, pour augmenter la puissance musculaire et l’endurance tout en évitant les accidents, la biologie est entrée dans la course.
To get content containing either thought or leadership enter:
To get content containing both thought and leadership enter:
To get content containing the expression thought leadership enter:
You can enter several keywords and you can refine them whenever you want. Our suggestion engine uses more signals but entering a few keywords here will rapidly give you great content to curate.
Your new post is loading...
